Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RP1P56715 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RP1P56715 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RP1P56715 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RP1P56715 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RP1P56715 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RP1P56715 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RP1P56715 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RP1P56715 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RP1P56715 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RP1P56715 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RP1P56715 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RP1P56715 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RP1P56715 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RP1P56715 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RP1P56715 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RP1P56715 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RP1P56715 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RP1P56715 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RP1P56715 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RP1P56715 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RP1P56715 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RP1P56715 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RP1P56715 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RP1P56715 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RP1P56715 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RP1P56715 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RP1P56715 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RP1P56715 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RP1P56715 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RP1P56715 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RP1P56715 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RP1P56715 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RP1P56715 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RP1P56715 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RP1P56715 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RP1P56715 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RP1P56715 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RP1P56715 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RP1P56715 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RP1P56715 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RP1P56715 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RP1P56715 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RP1P56715 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RP1P56715 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RP1P56715 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RP1P56715 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RP1P56715 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RP1P56715 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RP1P56715 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RP1P56715 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RP1P56715 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RP1P56715 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RP1P56715 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RP1P56715 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RP1P56715 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RP1P56715 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RP1P56715 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RP1P56715 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RP1P56715 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RP1P56715 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RP1P56715 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RP1P56715 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RP1P56715 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RP1P56715 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RP1P56715 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RP1P56715 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RP1P56715 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RP1P56715 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RP1P56715 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RP1P56715 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RP1P56715 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RP1P56715 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RP1P56715 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RP1P56715 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RP1P56715 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RP1P56715 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RP1P56715 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RP1P56715 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RP1P56715 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RP1P56715 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RP1P56715 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RP1P56715 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RP1P56715 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RP1P56715 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RP1P56715 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RP1P56715 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RP1P56715 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RP1P56715 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RP1P56715 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RP1P56715 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RP1P56715 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RP1P56715 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RP1P56715 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RP1P56715 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms