Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGALS4P56470 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGALS4P56470 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGALS4P56470 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LGALS4P56470 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGALS4P56470 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGALS4P56470 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGALS4P56470 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGALS4P56470 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms