Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPD52P55327 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPD52P55327 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPD52P55327 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52P55327 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52P55327 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPD52P55327 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPD52P55327 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPD52P55327 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPD52P55327 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPD52P55327 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPD52P55327 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPD52P55327 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPD52P55327 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPD52P55327 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52P55327 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPD52P55327 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52P55327 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPD52P55327 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPD52P55327 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPD52P55327 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPD52P55327 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPD52P55327 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52P55327 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52P55327 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPD52P55327 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52P55327 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52P55327 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52P55327 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPD52P55327 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPD52P55327 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TPD52P55327 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPD52P55327 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPD52P55327 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPD52P55327 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPD52P55327 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPD52P55327 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPD52P55327 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPD52P55327 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPD52P55327 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52P55327 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52P55327 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPD52P55327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52P55327 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52P55327 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52P55327 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52P55327 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPD52P55327 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPD52P55327 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPD52P55327 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPD52P55327 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPD52P55327 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPD52P55327 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPD52P55327 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPD52P55327 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPD52P55327 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPD52P55327 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPD52P55327 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPD52P55327 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPD52P55327 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPD52P55327 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52P55327 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52P55327 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52P55327 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPD52P55327 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPD52P55327 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52P55327 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52P55327 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52P55327 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52P55327 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52P55327 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPD52P55327 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPD52P55327 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPD52P55327 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPD52P55327 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TPD52P55327 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPD52P55327 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPD52P55327 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPD52P55327 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPD52P55327 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPD52P55327 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPD52P55327 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52P55327 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52P55327 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52P55327 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52P55327 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52P55327 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPD52P55327 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPD52P55327 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPD52P55327 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPD52P55327 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPD52P55327 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPD52P55327 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPD52P55327 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms