Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EMP3P54852 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EMP3P54852 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMP3P54852 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMP3P54852 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMP3P54852 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMP3P54852 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMP3P54852 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMP3P54852 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMP3P54852 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMP3P54852 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMP3P54852 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMP3P54852 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMP3P54852 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMP3P54852 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMP3P54852 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMP3P54852 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMP3P54852 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMP3P54852 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMP3P54852 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMP3P54852 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMP3P54852 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMP3P54852 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMP3P54852 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMP3P54852 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMP3P54852 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMP3P54852 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMP3P54852 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMP3P54852 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMP3P54852 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EMP3P54852 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMP3P54852 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMP3P54852 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMP3P54852 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EMP3P54852 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EMP3P54852 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMP3P54852 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMP3P54852 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMP3P54852 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMP3P54852 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMP3P54852 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMP3P54852 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMP3P54852 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMP3P54852 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMP3P54852 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMP3P54852 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMP3P54852 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMP3P54852 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMP3P54852 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMP3P54852 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMP3P54852 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMP3P54852 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMP3P54852 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMP3P54852 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMP3P54852 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EMP3P54852 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMP3P54852 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMP3P54852 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMP3P54852 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMP3P54852 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMP3P54852 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMP3P54852 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMP3P54852 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMP3P54852 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMP3P54852 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMP3P54852 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EMP3P54852 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EMP3P54852 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMP3P54852 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMP3P54852 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EMP3P54852 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMP3P54852 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EMP3P54852 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EMP3P54852 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMP3P54852 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMP3P54852 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EMP3P54852 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EMP3P54852 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EMP3P54852 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMP3P54852 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EMP3P54852 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EMP3P54852 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EMP3P54852 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EMP3P54852 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EMP3P54852 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EMP3P54852 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EMP3P54852 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMP3P54852 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMP3P54852 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMP3P54852 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMP3P54852 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EMP3P54852 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EMP3P54852 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EMP3P54852 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EMP3P54852 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMP3P54852 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EMP3P54852 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EMP3P54852 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EMP3P54852 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EMP3P54852 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms