Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPHA4P54764 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPHA4P54764 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPHA4P54764 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPHA4P54764 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPHA4P54764 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPHA4P54764 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPHA4P54764 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPHA4P54764 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPHA4P54764 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms