Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
EPHB4P54760 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EPHB4P54760 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EPHB4P54760 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EPHB4P54760 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EPHB4P54760 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EPHB4P54760 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EPHB4P54760 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EPHB4P54760 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EPHB4P54760 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EPHB4P54760 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EPHB4P54760 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EPHB4P54760 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EPHB4P54760 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms