Protein–RNA interactions for Protein: P54756

EPHA5, Ephrin type-A receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA5P54756 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPHA5P54756 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHA5P54756 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHA5P54756 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHA5P54756 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHA5P54756 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHA5P54756 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHA5P54756 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHA5P54756 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms