Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
BLMP54132 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
BLMP54132 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
BLMP54132 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
BLMP54132 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
BLMP54132 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
BLMP54132 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
BLMP54132 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
BLMP54132 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
BLMP54132 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
BLMP54132 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
BLMP54132 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BLMP54132 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BLMP54132 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
BLMP54132 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
BLMP54132 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
BLMP54132 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BLMP54132 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
BLMP54132 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
BLMP54132 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
BLMP54132 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
BLMP54132 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
BLMP54132 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BLMP54132 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
BLMP54132 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
BLMP54132 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
BLMP54132 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
BLMP54132 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
BLMP54132 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
BLMP54132 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
BLMP54132 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BLMP54132 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
BLMP54132 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BLMP54132 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
BLMP54132 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BLMP54132 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
BLMP54132 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BLMP54132 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
BLMP54132 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
BLMP54132 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BLMP54132 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BLMP54132 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
BLMP54132 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BLMP54132 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
BLMP54132 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BLMP54132 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BLMP54132 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BLMP54132 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
BLMP54132 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BLMP54132 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BLMP54132 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BLMP54132 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BLMP54132 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
BLMP54132 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BLMP54132 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BLMP54132 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BLMP54132 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BLMP54132 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BLMP54132 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BLMP54132 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BLMP54132 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BLMP54132 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
BLMP54132 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BLMP54132 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
BLMP54132 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
BLMP54132 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BLMP54132 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
BLMP54132 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BLMP54132 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
BLMP54132 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BLMP54132 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BLMP54132 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BLMP54132 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BLMP54132 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BLMP54132 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
BLMP54132 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BLMP54132 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BLMP54132 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
BLMP54132 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BLMP54132 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BLMP54132 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BLMP54132 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
BLMP54132 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
BLMP54132 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
BLMP54132 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
BLMP54132 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
BLMP54132 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
BLMP54132 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
BLMP54132 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
BLMP54132 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
BLMP54132 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
BLMP54132 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
BLMP54132 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
BLMP54132 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
BLMP54132 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
BLMP54132 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
BLMP54132 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
BLMP54132 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BLMP54132 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
BLMP54132 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms