Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMTNP53814 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMTNP53814 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMTNP53814 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMTNP53814 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMTNP53814 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SMTNP53814 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNP53814 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SMTNP53814 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMTNP53814 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMTNP53814 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMTNP53814 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMTNP53814 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMTNP53814 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMTNP53814 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMTNP53814 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMTNP53814 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMTNP53814 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMTNP53814 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMTNP53814 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMTNP53814 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMTNP53814 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMTNP53814 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMTNP53814 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMTNP53814 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMTNP53814 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMTNP53814 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMTNP53814 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMTNP53814 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMTNP53814 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMTNP53814 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMTNP53814 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMTNP53814 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMTNP53814 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMTNP53814 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMTNP53814 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMTNP53814 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMTNP53814 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMTNP53814 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNP53814 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNP53814 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMTNP53814 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMTNP53814 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMTNP53814 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMTNP53814 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMTNP53814 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNP53814 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNP53814 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMTNP53814 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMTNP53814 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMTNP53814 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMTNP53814 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMTNP53814 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMTNP53814 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMTNP53814 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNP53814 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMTNP53814 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMTNP53814 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMTNP53814 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMTNP53814 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMTNP53814 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMTNP53814 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMTNP53814 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMTNP53814 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNP53814 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNP53814 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNP53814 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMTNP53814 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMTNP53814 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMTNP53814 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNP53814 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNP53814 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMTNP53814 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMTNP53814 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMTNP53814 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMTNP53814 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNP53814 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMTNP53814 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMTNP53814 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMTNP53814 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMTNP53814 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMTNP53814 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMTNP53814 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMTNP53814 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMTNP53814 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMTNP53814 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMTNP53814 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms