Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EFNA5P52803 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EFNA5P52803 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EFNA5P52803 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EFNA5P52803 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EFNA5P52803 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EFNA5P52803 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
EFNA5P52803 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EFNA5P52803 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFNA5P52803 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EFNA5P52803 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EFNA5P52803 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFNA5P52803 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFNA5P52803 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFNA5P52803 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms