Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK3P51956 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK3P51956 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK3P51956 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK3P51956 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK3P51956 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK3P51956 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK3P51956 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK3P51956 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK3P51956 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK3P51956 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK3P51956 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK3P51956 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK3P51956 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEK3P51956 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK3P51956 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK3P51956 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK3P51956 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK3P51956 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK3P51956 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK3P51956 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK3P51956 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK3P51956 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEK3P51956 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK3P51956 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK3P51956 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK3P51956 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK3P51956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK3P51956 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK3P51956 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK3P51956 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK3P51956 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK3P51956 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK3P51956 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK3P51956 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK3P51956 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK3P51956 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK3P51956 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK3P51956 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK3P51956 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK3P51956 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK3P51956 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK3P51956 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK3P51956 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK3P51956 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK3P51956 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK3P51956 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK3P51956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK3P51956 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK3P51956 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK3P51956 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK3P51956 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK3P51956 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEK3P51956 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK3P51956 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK3P51956 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK3P51956 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK3P51956 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEK3P51956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NEK3P51956 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEK3P51956 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK3P51956 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEK3P51956 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK3P51956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NEK3P51956 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEK3P51956 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEK3P51956 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK3P51956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK3P51956 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEK3P51956 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEK3P51956 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK3P51956 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK3P51956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEK3P51956 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK3P51956 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK3P51956 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK3P51956 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK3P51956 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK3P51956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK3P51956 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK3P51956 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK3P51956 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK3P51956 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK3P51956 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK3P51956 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEK3P51956 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK3P51956 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NEK3P51956 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK3P51956 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NEK3P51956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK3P51956 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK3P51956 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK3P51956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK3P51956 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK3P51956 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms