Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LUMP51884 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LUMP51884 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LUMP51884 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LUMP51884 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LUMP51884 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LUMP51884 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LUMP51884 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LUMP51884 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LUMP51884 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LUMP51884 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LUMP51884 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LUMP51884 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LUMP51884 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LUMP51884 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LUMP51884 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LUMP51884 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LUMP51884 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LUMP51884 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LUMP51884 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LUMP51884 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LUMP51884 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LUMP51884 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LUMP51884 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LUMP51884 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LUMP51884 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LUMP51884 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LUMP51884 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LUMP51884 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LUMP51884 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LUMP51884 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LUMP51884 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LUMP51884 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LUMP51884 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LUMP51884 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LUMP51884 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LUMP51884 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LUMP51884 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LUMP51884 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LUMP51884 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LUMP51884 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LUMP51884 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LUMP51884 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LUMP51884 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LUMP51884 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LUMP51884 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LUMP51884 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LUMP51884 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LUMP51884 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LUMP51884 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LUMP51884 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LUMP51884 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LUMP51884 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LUMP51884 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LUMP51884 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LUMP51884 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LUMP51884 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LUMP51884 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LUMP51884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LUMP51884 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LUMP51884 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LUMP51884 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LUMP51884 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LUMP51884 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LUMP51884 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LUMP51884 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LUMP51884 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LUMP51884 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LUMP51884 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LUMP51884 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LUMP51884 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LUMP51884 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LUMP51884 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LUMP51884 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LUMP51884 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LUMP51884 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LUMP51884 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LUMP51884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LUMP51884 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LUMP51884 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LUMP51884 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LUMP51884 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LUMP51884 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LUMP51884 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LUMP51884 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LUMP51884 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LUMP51884 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LUMP51884 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LUMP51884 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LUMP51884 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms