Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK9P50750 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK9P50750 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK9P50750 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK9P50750 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK9P50750 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK9P50750 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK9P50750 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK9P50750 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK9P50750 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK9P50750 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK9P50750 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK9P50750 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK9P50750 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK9P50750 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK9P50750 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK9P50750 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK9P50750 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK9P50750 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK9P50750 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK9P50750 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK9P50750 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK9P50750 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK9P50750 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK9P50750 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK9P50750 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK9P50750 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK9P50750 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK9P50750 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK9P50750 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK9P50750 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK9P50750 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK9P50750 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK9P50750 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK9P50750 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK9P50750 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK9P50750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK9P50750 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK9P50750 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK9P50750 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK9P50750 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK9P50750 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK9P50750 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK9P50750 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK9P50750 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK9P50750 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK9P50750 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK9P50750 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK9P50750 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK9P50750 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK9P50750 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK9P50750 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK9P50750 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK9P50750 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK9P50750 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK9P50750 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK9P50750 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK9P50750 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK9P50750 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK9P50750 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK9P50750 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK9P50750 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK9P50750 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK9P50750 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK9P50750 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK9P50750 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK9P50750 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK9P50750 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK9P50750 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK9P50750 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK9P50750 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK9P50750 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK9P50750 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK9P50750 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK9P50750 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK9P50750 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK9P50750 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK9P50750 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK9P50750 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK9P50750 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK9P50750 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK9P50750 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK9P50750 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK9P50750 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK9P50750 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK9P50750 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK9P50750 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK9P50750 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK9P50750 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK9P50750 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK9P50750 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK9P50750 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK9P50750 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK9P50750 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK9P50750 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK9P50750 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK9P50750 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK9P50750 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK9P50750 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK9P50750 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms