Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNTC1P50748 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNTC1P50748 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNTC1P50748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KNTC1P50748 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNTC1P50748 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KNTC1P50748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KNTC1P50748 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KNTC1P50748 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNTC1P50748 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms