Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GSK3BP49841 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GSK3BP49841 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSK3BP49841 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSK3BP49841 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSK3BP49841 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSK3BP49841 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GSK3BP49841 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GSK3BP49841 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms