Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSEN1P49768 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSEN1P49768 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSEN1P49768 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSEN1P49768 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSEN1P49768 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSEN1P49768 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSEN1P49768 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSEN1P49768 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSEN1P49768 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSEN1P49768 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms