Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLK1P49759 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK1P49759 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLK1P49759 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK1P49759 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLK1P49759 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK1P49759 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK1P49759 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLK1P49759 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK1P49759 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLK1P49759 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLK1P49759 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK1P49759 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLK1P49759 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK1P49759 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK1P49759 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK1P49759 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLK1P49759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK1P49759 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLK1P49759 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK1P49759 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK1P49759 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK1P49759 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLK1P49759 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK1P49759 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLK1P49759 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK1P49759 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLK1P49759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK1P49759 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK1P49759 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLK1P49759 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK1P49759 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK1P49759 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK1P49759 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLK1P49759 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK1P49759 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK1P49759 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLK1P49759 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLK1P49759 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLK1P49759 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK1P49759 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLK1P49759 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK1P49759 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK1P49759 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLK1P49759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK1P49759 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLK1P49759 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLK1P49759 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK1P49759 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK1P49759 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLK1P49759 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLK1P49759 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLK1P49759 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK1P49759 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLK1P49759 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLK1P49759 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK1P49759 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLK1P49759 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK1P49759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK1P49759 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLK1P49759 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK1P49759 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK1P49759 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLK1P49759 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK1P49759 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLK1P49759 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLK1P49759 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK1P49759 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLK1P49759 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLK1P49759 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK1P49759 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLK1P49759 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLK1P49759 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK1P49759 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLK1P49759 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLK1P49759 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK1P49759 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLK1P49759 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLK1P49759 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLK1P49759 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK1P49759 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLK1P49759 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK1P49759 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLK1P49759 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK1P49759 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK1P49759 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLK1P49759 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLK1P49759 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK1P49759 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLK1P49759 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLK1P49759 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms