Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27AP46776 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27AP46776 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27AP46776 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27AP46776 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL27AP46776 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL27AP46776 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL27AP46776 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL27AP46776 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL27AP46776 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL27AP46776 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL27AP46776 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27AP46776 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27AP46776 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL27AP46776 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27AP46776 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL27AP46776 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL27AP46776 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27AP46776 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27AP46776 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27AP46776 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27AP46776 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL27AP46776 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL27AP46776 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL27AP46776 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL27AP46776 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms