Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TNNT2P45379 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TNNT2P45379 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TNNT2P45379 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TNNT2P45379 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TNNT2P45379 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TNNT2P45379 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TNNT2P45379 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TNNT2P45379 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNNT2P45379 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNNT2P45379 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNNT2P45379 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNNT2P45379 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNNT2P45379 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNNT2P45379 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TNNT2P45379 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNNT2P45379 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNNT2P45379 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNNT2P45379 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNNT2P45379 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNNT2P45379 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms