Protein–RNA interactions for Protein: P42696

RBM34, RNA-binding protein 34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM34P42696 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM34P42696 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM34P42696 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM34P42696 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM34P42696 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM34P42696 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM34P42696 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM34P42696 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM34P42696 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM34P42696 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM34P42696 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBM34P42696 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM34P42696 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM34P42696 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM34P42696 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM34P42696 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM34P42696 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM34P42696 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM34P42696 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM34P42696 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM34P42696 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM34P42696 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM34P42696 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBM34P42696 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM34P42696 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM34P42696 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM34P42696 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM34P42696 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM34P42696 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM34P42696 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM34P42696 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM34P42696 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM34P42696 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM34P42696 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM34P42696 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM34P42696 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM34P42696 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM34P42696 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM34P42696 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM34P42696 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM34P42696 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM34P42696 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM34P42696 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM34P42696 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM34P42696 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM34P42696 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM34P42696 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM34P42696 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM34P42696 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM34P42696 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM34P42696 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM34P42696 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM34P42696 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM34P42696 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM34P42696 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM34P42696 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM34P42696 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM34P42696 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM34P42696 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM34P42696 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM34P42696 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBM34P42696 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBM34P42696 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM34P42696 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM34P42696 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM34P42696 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBM34P42696 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM34P42696 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBM34P42696 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM34P42696 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBM34P42696 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBM34P42696 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBM34P42696 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBM34P42696 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM34P42696 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM34P42696 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBM34P42696 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBM34P42696 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBM34P42696 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM34P42696 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM34P42696 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM34P42696 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBM34P42696 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBM34P42696 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM34P42696 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM34P42696 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM34P42696 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBM34P42696 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBM34P42696 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms