Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECI1P42126 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECI1P42126 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECI1P42126 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECI1P42126 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECI1P42126 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECI1P42126 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECI1P42126 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECI1P42126 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ECI1P42126 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECI1P42126 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECI1P42126 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECI1P42126 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECI1P42126 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECI1P42126 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECI1P42126 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECI1P42126 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECI1P42126 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECI1P42126 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECI1P42126 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECI1P42126 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECI1P42126 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECI1P42126 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECI1P42126 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECI1P42126 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECI1P42126 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECI1P42126 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECI1P42126 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECI1P42126 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ECI1P42126 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ECI1P42126 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECI1P42126 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ECI1P42126 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECI1P42126 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECI1P42126 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECI1P42126 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECI1P42126 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ECI1P42126 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECI1P42126 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ECI1P42126 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECI1P42126 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ECI1P42126 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ECI1P42126 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECI1P42126 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECI1P42126 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ECI1P42126 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECI1P42126 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ECI1P42126 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECI1P42126 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECI1P42126 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECI1P42126 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECI1P42126 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECI1P42126 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ECI1P42126 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECI1P42126 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ECI1P42126 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECI1P42126 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECI1P42126 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECI1P42126 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECI1P42126 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECI1P42126 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECI1P42126 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECI1P42126 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECI1P42126 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECI1P42126 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECI1P42126 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECI1P42126 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECI1P42126 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECI1P42126 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECI1P42126 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECI1P42126 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECI1P42126 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECI1P42126 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECI1P42126 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECI1P42126 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECI1P42126 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECI1P42126 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECI1P42126 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECI1P42126 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECI1P42126 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECI1P42126 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECI1P42126 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECI1P42126 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECI1P42126 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECI1P42126 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ECI1P42126 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ECI1P42126 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECI1P42126 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ECI1P42126 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECI1P42126 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ECI1P42126 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ECI1P42126 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECI1P42126 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ECI1P42126 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms