Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCIP41743 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCIP41743 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRKCIP41743 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCIP41743 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCIP41743 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKCIP41743 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRKCIP41743 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCIP41743 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms