Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC26A3P40879 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC26A3P40879 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC26A3P40879 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC26A3P40879 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC26A3P40879 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC26A3P40879 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC26A3P40879 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC26A3P40879 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC26A3P40879 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC26A3P40879 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC26A3P40879 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC26A3P40879 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms