Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACTN2P35609 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACTN2P35609 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACTN2P35609 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACTN2P35609 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN2P35609 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN2P35609 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN2P35609 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN2P35609 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN2P35609 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms