Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS2P35442 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THBS2P35442 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS2P35442 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS2P35442 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THBS2P35442 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THBS2P35442 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THBS2P35442 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS2P35442 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS2P35442 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS2P35442 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THBS2P35442 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS2P35442 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS2P35442 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THBS2P35442 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THBS2P35442 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS2P35442 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS2P35442 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THBS2P35442 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THBS2P35442 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THBS2P35442 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS2P35442 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THBS2P35442 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THBS2P35442 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS2P35442 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THBS2P35442 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS2P35442 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS2P35442 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THBS2P35442 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS2P35442 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS2P35442 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THBS2P35442 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS2P35442 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS2P35442 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THBS2P35442 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
THBS2P35442 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS2P35442 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS2P35442 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS2P35442 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THBS2P35442 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THBS2P35442 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS2P35442 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS2P35442 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS2P35442 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THBS2P35442 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THBS2P35442 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS2P35442 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS2P35442 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS2P35442 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS2P35442 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THBS2P35442 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THBS2P35442 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
THBS2P35442 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
THBS2P35442 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THBS2P35442 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
THBS2P35442 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THBS2P35442 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS2P35442 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS2P35442 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS2P35442 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THBS2P35442 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THBS2P35442 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THBS2P35442 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THBS2P35442 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THBS2P35442 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THBS2P35442 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THBS2P35442 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THBS2P35442 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
THBS2P35442 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THBS2P35442 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS2P35442 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS2P35442 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THBS2P35442 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
THBS2P35442 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
THBS2P35442 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS2P35442 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THBS2P35442 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS2P35442 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THBS2P35442 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THBS2P35442 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THBS2P35442 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THBS2P35442 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THBS2P35442 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THBS2P35442 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THBS2P35442 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THBS2P35442 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS2P35442 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THBS2P35442 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS2P35442 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THBS2P35442 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THBS2P35442 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THBS2P35442 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS2P35442 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS2P35442 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THBS2P35442 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms