Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RORAP35398 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RORAP35398 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RORAP35398 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RORAP35398 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RORAP35398 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RORAP35398 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RORAP35398 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RORAP35398 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RORAP35398 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RORAP35398 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RORAP35398 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RORAP35398 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RORAP35398 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RORAP35398 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RORAP35398 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORAP35398 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORAP35398 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORAP35398 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORAP35398 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RORAP35398 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RORAP35398 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RORAP35398 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RORAP35398 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RORAP35398 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RORAP35398 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RORAP35398 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RORAP35398 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RORAP35398 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RORAP35398 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RORAP35398 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RORAP35398 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RORAP35398 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RORAP35398 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RORAP35398 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RORAP35398 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RORAP35398 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RORAP35398 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RORAP35398 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RORAP35398 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RORAP35398 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RORAP35398 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RORAP35398 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RORAP35398 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RORAP35398 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RORAP35398 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RORAP35398 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RORAP35398 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RORAP35398 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RORAP35398 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RORAP35398 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RORAP35398 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RORAP35398 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RORAP35398 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RORAP35398 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RORAP35398 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RORAP35398 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RORAP35398 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORAP35398 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORAP35398 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORAP35398 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORAP35398 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RORAP35398 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RORAP35398 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RORAP35398 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RORAP35398 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RORAP35398 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RORAP35398 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RORAP35398 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RORAP35398 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RORAP35398 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORAP35398 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORAP35398 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORAP35398 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORAP35398 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RORAP35398 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RORAP35398 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RORAP35398 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RORAP35398 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RORAP35398 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RORAP35398 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RORAP35398 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RORAP35398 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RORAP35398 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORAP35398 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORAP35398 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORAP35398 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RORAP35398 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RORAP35398 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RORAP35398 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RORAP35398 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RORAP35398 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RORAP35398 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RORAP35398 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RORAP35398 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms