Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RDXP35241 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RDXP35241 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RDXP35241 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RDXP35241 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RDXP35241 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RDXP35241 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RDXP35241 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RDXP35241 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RDXP35241 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RDXP35241 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RDXP35241 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RDXP35241 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RDXP35241 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RDXP35241 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RDXP35241 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RDXP35241 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RDXP35241 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RDXP35241 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RDXP35241 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RDXP35241 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RDXP35241 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RDXP35241 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RDXP35241 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RDXP35241 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RDXP35241 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RDXP35241 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RDXP35241 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RDXP35241 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RDXP35241 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RDXP35241 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RDXP35241 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RDXP35241 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RDXP35241 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RDXP35241 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RDXP35241 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RDXP35241 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RDXP35241 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RDXP35241 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RDXP35241 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RDXP35241 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RDXP35241 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RDXP35241 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RDXP35241 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RDXP35241 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RDXP35241 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RDXP35241 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RDXP35241 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RDXP35241 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RDXP35241 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RDXP35241 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RDXP35241 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RDXP35241 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RDXP35241 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RDXP35241 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RDXP35241 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RDXP35241 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RDXP35241 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RDXP35241 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RDXP35241 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RDXP35241 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RDXP35241 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RDXP35241 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RDXP35241 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDXP35241 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDXP35241 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDXP35241 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RDXP35241 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RDXP35241 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RDXP35241 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RDXP35241 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RDXP35241 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RDXP35241 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RDXP35241 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RDXP35241 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RDXP35241 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RDXP35241 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RDXP35241 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RDXP35241 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RDXP35241 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RDXP35241 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RDXP35241 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RDXP35241 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDXP35241 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RDXP35241 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RDXP35241 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RDXP35241 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RDXP35241 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RDXP35241 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RDXP35241 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms