Protein–RNA interactions for Protein: P31641

SLC6A6, Sodium- and chloride-dependent taurine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A6P31641 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC6A6P31641 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC6A6P31641 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC6A6P31641 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC6A6P31641 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC6A6P31641 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A6P31641 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A6P31641 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms