Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CASP1P29466 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CASP1P29466 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CASP1P29466 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CASP1P29466 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CASP1P29466 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP1P29466 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP1P29466 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CASP1P29466 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CASP1P29466 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CASP1P29466 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP1P29466 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP1P29466 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CASP1P29466 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP1P29466 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CASP1P29466 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CASP1P29466 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CASP1P29466 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP1P29466 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP1P29466 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CASP1P29466 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CASP1P29466 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP1P29466 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CASP1P29466 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP1P29466 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CASP1P29466 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CASP1P29466 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CASP1P29466 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP1P29466 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP1P29466 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP1P29466 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CASP1P29466 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CASP1P29466 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CASP1P29466 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASP1P29466 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CASP1P29466 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASP1P29466 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASP1P29466 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASP1P29466 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CASP1P29466 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CASP1P29466 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CASP1P29466 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP1P29466 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP1P29466 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CASP1P29466 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP1P29466 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CASP1P29466 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP1P29466 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CASP1P29466 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP1P29466 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CASP1P29466 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP1P29466 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CASP1P29466 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CASP1P29466 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CASP1P29466 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASP1P29466 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASP1P29466 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CASP1P29466 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CASP1P29466 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CASP1P29466 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP1P29466 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CASP1P29466 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP1P29466 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP1P29466 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CASP1P29466 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP1P29466 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CASP1P29466 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP1P29466 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP1P29466 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CASP1P29466 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CASP1P29466 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CASP1P29466 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CASP1P29466 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP1P29466 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CASP1P29466 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP1P29466 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP1P29466 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP1P29466 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP1P29466 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CASP1P29466 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP1P29466 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP1P29466 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CASP1P29466 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CASP1P29466 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CASP1P29466 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CASP1P29466 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP1P29466 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CASP1P29466 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP1P29466 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CASP1P29466 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP1P29466 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP1P29466 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP1P29466 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CASP1P29466 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms