Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD34P28906 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD34P28906 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD34P28906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD34P28906 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD34P28906 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD34P28906 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD34P28906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD34P28906 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD34P28906 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD34P28906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD34P28906 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD34P28906 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD34P28906 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD34P28906 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD34P28906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD34P28906 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD34P28906 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD34P28906 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD34P28906 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD34P28906 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD34P28906 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD34P28906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD34P28906 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD34P28906 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD34P28906 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD34P28906 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD34P28906 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD34P28906 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD34P28906 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD34P28906 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD34P28906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD34P28906 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD34P28906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD34P28906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD34P28906 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD34P28906 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CD34P28906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD34P28906 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD34P28906 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD34P28906 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD34P28906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD34P28906 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD34P28906 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD34P28906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD34P28906 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD34P28906 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD34P28906 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD34P28906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD34P28906 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD34P28906 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD34P28906 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD34P28906 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD34P28906 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD34P28906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD34P28906 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD34P28906 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD34P28906 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD34P28906 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD34P28906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD34P28906 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD34P28906 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD34P28906 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD34P28906 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD34P28906 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD34P28906 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD34P28906 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD34P28906 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD34P28906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD34P28906 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD34P28906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD34P28906 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD34P28906 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD34P28906 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD34P28906 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD34P28906 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD34P28906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD34P28906 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD34P28906 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD34P28906 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD34P28906 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD34P28906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD34P28906 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD34P28906 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD34P28906 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD34P28906 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD34P28906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD34P28906 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD34P28906 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD34P28906 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD34P28906 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD34P28906 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD34P28906 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD34P28906 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD34P28906 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD34P28906 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD34P28906 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD34P28906 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD34P28906 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD34P28906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms