Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CANXP27824 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CANXP27824 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CANXP27824 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CANXP27824 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CANXP27824 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CANXP27824 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CANXP27824 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CANXP27824 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CANXP27824 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CANXP27824 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CANXP27824 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CANXP27824 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CANXP27824 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CANXP27824 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CANXP27824 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CANXP27824 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CANXP27824 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CANXP27824 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CANXP27824 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CANXP27824 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CANXP27824 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CANXP27824 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CANXP27824 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CANXP27824 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CANXP27824 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CANXP27824 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CANXP27824 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CANXP27824 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CANXP27824 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CANXP27824 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CANXP27824 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CANXP27824 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CANXP27824 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CANXP27824 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CANXP27824 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CANXP27824 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CANXP27824 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CANXP27824 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CANXP27824 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CANXP27824 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CANXP27824 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CANXP27824 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CANXP27824 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CANXP27824 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CANXP27824 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CANXP27824 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CANXP27824 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CANXP27824 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CANXP27824 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CANXP27824 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CANXP27824 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CANXP27824 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CANXP27824 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CANXP27824 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CANXP27824 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CANXP27824 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CANXP27824 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CANXP27824 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CANXP27824 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CANXP27824 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CANXP27824 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CANXP27824 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CANXP27824 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CANXP27824 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CANXP27824 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CANXP27824 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CANXP27824 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CANXP27824 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CANXP27824 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CANXP27824 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CANXP27824 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CANXP27824 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CANXP27824 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CANXP27824 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CANXP27824 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CANXP27824 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CANXP27824 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CANXP27824 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CANXP27824 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CANXP27824 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CANXP27824 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CANXP27824 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CANXP27824 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CANXP27824 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CANXP27824 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CANXP27824 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CANXP27824 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CANXP27824 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CANXP27824 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CANXP27824 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CANXP27824 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CANXP27824 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CANXP27824 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CANXP27824 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms