Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRYBB3P26998 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CRYBB3P26998 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRYBB3P26998 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRYBB3P26998 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CRYBB3P26998 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRYBB3P26998 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRYBB3P26998 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms