Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VARSP26640 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VARSP26640 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VARSP26640 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VARSP26640 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VARSP26640 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VARSP26640 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VARSP26640 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VARSP26640 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VARSP26640 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VARSP26640 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VARSP26640 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VARSP26640 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VARSP26640 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VARSP26640 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VARSP26640 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VARSP26640 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VARSP26640 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VARSP26640 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VARSP26640 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VARSP26640 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VARSP26640 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VARSP26640 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VARSP26640 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VARSP26640 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VARSP26640 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VARSP26640 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VARSP26640 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VARSP26640 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VARSP26640 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VARSP26640 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VARSP26640 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VARSP26640 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VARSP26640 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VARSP26640 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VARSP26640 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VARSP26640 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VARSP26640 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VARSP26640 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VARSP26640 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VARSP26640 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VARSP26640 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VARSP26640 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VARSP26640 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VARSP26640 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VARSP26640 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VARSP26640 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VARSP26640 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VARSP26640 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VARSP26640 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VARSP26640 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARSP26640 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARSP26640 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VARSP26640 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARSP26640 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARSP26640 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VARSP26640 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARSP26640 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARSP26640 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VARSP26640 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VARSP26640 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VARSP26640 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VARSP26640 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARSP26640 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARSP26640 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VARSP26640 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VARSP26640 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VARSP26640 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VARSP26640 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARSP26640 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VARSP26640 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VARSP26640 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VARSP26640 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VARSP26640 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VARSP26640 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VARSP26640 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VARSP26640 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VARSP26640 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VARSP26640 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VARSP26640 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VARSP26640 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VARSP26640 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VARSP26640 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VARSP26640 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VARSP26640 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VARSP26640 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VARSP26640 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VARSP26640 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VARSP26640 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VARSP26640 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VARSP26640 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VARSP26640 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VARSP26640 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VARSP26640 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VARSP26640 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VARSP26640 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VARSP26640 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VARSP26640 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VARSP26640 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VARSP26640 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms