Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB7P26010 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB7P26010 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB7P26010 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGB7P26010 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGB7P26010 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGB7P26010 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGB7P26010 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB7P26010 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms