Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GLRA1P23415 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLRA1P23415 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLRA1P23415 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLRA1P23415 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GLRA1P23415 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLRA1P23415 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLRA1P23415 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLRA1P23415 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms