Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPAP23025 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XPAP23025 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPAP23025 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XPAP23025 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XPAP23025 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XPAP23025 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPAP23025 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XPAP23025 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XPAP23025 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPAP23025 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPAP23025 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XPAP23025 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPAP23025 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XPAP23025 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XPAP23025 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XPAP23025 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPAP23025 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XPAP23025 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XPAP23025 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XPAP23025 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPAP23025 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XPAP23025 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPAP23025 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XPAP23025 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPAP23025 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPAP23025 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XPAP23025 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XPAP23025 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPAP23025 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XPAP23025 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPAP23025 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPAP23025 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPAP23025 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPAP23025 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPAP23025 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPAP23025 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPAP23025 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPAP23025 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPAP23025 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPAP23025 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPAP23025 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPAP23025 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XPAP23025 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPAP23025 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
XPAP23025 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPAP23025 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPAP23025 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPAP23025 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XPAP23025 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XPAP23025 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPAP23025 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPAP23025 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPAP23025 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPAP23025 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPAP23025 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPAP23025 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPAP23025 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPAP23025 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPAP23025 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPAP23025 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPAP23025 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPAP23025 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPAP23025 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPAP23025 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPAP23025 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPAP23025 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
XPAP23025 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPAP23025 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPAP23025 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPAP23025 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPAP23025 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPAP23025 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPAP23025 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPAP23025 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
XPAP23025 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPAP23025 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
XPAP23025 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPAP23025 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
XPAP23025 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XPAP23025 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPAP23025 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPAP23025 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XPAP23025 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPAP23025 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPAP23025 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XPAP23025 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XPAP23025 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPAP23025 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPAP23025 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPAP23025 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XPAP23025 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPAP23025 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPAP23025 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XPAP23025 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPAP23025 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XPAP23025 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
XPAP23025 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPAP23025 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XPAP23025 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms