Protein–RNA interactions for Protein: P22681

CBL, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLP22681 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBLP22681 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBLP22681 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBLP22681 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBLP22681 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBLP22681 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CBLP22681 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBLP22681 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBLP22681 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLP22681 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLP22681 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLP22681 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLP22681 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLP22681 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLP22681 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLP22681 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLP22681 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBLP22681 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBLP22681 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLP22681 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLP22681 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLP22681 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLP22681 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLP22681 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLP22681 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBLP22681 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBLP22681 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBLP22681 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBLP22681 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLP22681 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLP22681 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLP22681 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLP22681 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBLP22681 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBLP22681 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBLP22681 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBLP22681 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLP22681 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLP22681 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBLP22681 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBLP22681 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBLP22681 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBLP22681 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBLP22681 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBLP22681 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBLP22681 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBLP22681 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBLP22681 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLP22681 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLP22681 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLP22681 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLP22681 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBLP22681 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBLP22681 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBLP22681 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBLP22681 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBLP22681 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBLP22681 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLP22681 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLP22681 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLP22681 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLP22681 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLP22681 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLP22681 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBLP22681 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLP22681 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBLP22681 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBLP22681 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBLP22681 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBLP22681 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLP22681 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLP22681 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLP22681 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLP22681 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBLP22681 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBLP22681 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBLP22681 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBLP22681 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBLP22681 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLP22681 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLP22681 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLP22681 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLP22681 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLP22681 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLP22681 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLP22681 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLP22681 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLP22681 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLP22681 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBLP22681 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBLP22681 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBLP22681 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLP22681 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBLP22681 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBLP22681 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms