Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COMTP21964 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COMTP21964 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COMTP21964 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COMTP21964 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COMTP21964 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COMTP21964 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COMTP21964 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COMTP21964 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COMTP21964 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COMTP21964 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COMTP21964 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COMTP21964 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COMTP21964 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COMTP21964 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COMTP21964 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COMTP21964 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COMTP21964 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COMTP21964 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COMTP21964 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COMTP21964 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COMTP21964 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COMTP21964 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COMTP21964 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMTP21964 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMTP21964 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMTP21964 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COMTP21964 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COMTP21964 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COMTP21964 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COMTP21964 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COMTP21964 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COMTP21964 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COMTP21964 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COMTP21964 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COMTP21964 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COMTP21964 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COMTP21964 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMTP21964 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMTP21964 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMTP21964 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COMTP21964 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMTP21964 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMTP21964 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMTP21964 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COMTP21964 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COMTP21964 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COMTP21964 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COMTP21964 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COMTP21964 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COMTP21964 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
COMTP21964 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMTP21964 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMTP21964 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMTP21964 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMTP21964 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COMTP21964 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COMTP21964 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COMTP21964 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COMTP21964 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COMTP21964 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COMTP21964 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COMTP21964 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COMTP21964 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COMTP21964 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COMTP21964 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COMTP21964 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
COMTP21964 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COMTP21964 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMTP21964 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COMTP21964 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COMTP21964 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COMTP21964 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COMTP21964 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COMTP21964 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COMTP21964 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COMTP21964 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COMTP21964 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COMTP21964 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COMTP21964 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COMTP21964 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMTP21964 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMTP21964 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COMTP21964 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMTP21964 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMTP21964 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COMTP21964 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COMTP21964 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COMTP21964 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COMTP21964 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COMTP21964 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COMTP21964 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COMTP21964 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMTP21964 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMTP21964 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COMTP21964 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COMTP21964 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COMTP21964 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COMTP21964 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COMTP21964 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms