Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD58P19256 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CD58P19256 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CD58P19256 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CD58P19256 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CD58P19256 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CD58P19256 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD58P19256 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD58P19256 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD58P19256 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD58P19256 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD58P19256 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CD58P19256 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD58P19256 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD58P19256 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD58P19256 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD58P19256 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CD58P19256 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD58P19256 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD58P19256 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD58P19256 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD58P19256 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD58P19256 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CD58P19256 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CD58P19256 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD58P19256 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD58P19256 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CD58P19256 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD58P19256 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CD58P19256 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CD58P19256 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD58P19256 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD58P19256 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CD58P19256 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD58P19256 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CD58P19256 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CD58P19256 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD58P19256 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CD58P19256 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD58P19256 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD58P19256 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD58P19256 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD58P19256 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CD58P19256 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD58P19256 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD58P19256 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD58P19256 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CD58P19256 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD58P19256 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CD58P19256 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CD58P19256 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CD58P19256 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD58P19256 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD58P19256 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD58P19256 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CD58P19256 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CD58P19256 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD58P19256 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD58P19256 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CD58P19256 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD58P19256 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD58P19256 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CD58P19256 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD58P19256 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CD58P19256 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CD58P19256 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CD58P19256 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD58P19256 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD58P19256 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD58P19256 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CD58P19256 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD58P19256 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD58P19256 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CD58P19256 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD58P19256 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CD58P19256 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD58P19256 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD58P19256 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CD58P19256 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD58P19256 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD58P19256 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CD58P19256 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CD58P19256 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD58P19256 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD58P19256 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CD58P19256 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD58P19256 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD58P19256 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD58P19256 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD58P19256 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD58P19256 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CD58P19256 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD58P19256 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CD58P19256 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD58P19256 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD58P19256 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CD58P19256 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD58P19256 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CD58P19256 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CD58P19256 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms