Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STMN1P16949 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STMN1P16949 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STMN1P16949 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STMN1P16949 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STMN1P16949 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STMN1P16949 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STMN1P16949 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STMN1P16949 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STMN1P16949 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STMN1P16949 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STMN1P16949 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STMN1P16949 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STMN1P16949 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STMN1P16949 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STMN1P16949 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STMN1P16949 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STMN1P16949 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STMN1P16949 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STMN1P16949 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
STMN1P16949 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STMN1P16949 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STMN1P16949 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STMN1P16949 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STMN1P16949 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STMN1P16949 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STMN1P16949 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STMN1P16949 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STMN1P16949 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STMN1P16949 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
STMN1P16949 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STMN1P16949 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STMN1P16949 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STMN1P16949 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STMN1P16949 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STMN1P16949 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STMN1P16949 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STMN1P16949 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STMN1P16949 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STMN1P16949 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STMN1P16949 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STMN1P16949 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STMN1P16949 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STMN1P16949 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STMN1P16949 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STMN1P16949 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STMN1P16949 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STMN1P16949 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STMN1P16949 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STMN1P16949 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STMN1P16949 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STMN1P16949 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STMN1P16949 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
STMN1P16949 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STMN1P16949 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STMN1P16949 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STMN1P16949 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STMN1P16949 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STMN1P16949 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STMN1P16949 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STMN1P16949 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STMN1P16949 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STMN1P16949 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STMN1P16949 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STMN1P16949 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STMN1P16949 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STMN1P16949 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STMN1P16949 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STMN1P16949 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STMN1P16949 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STMN1P16949 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STMN1P16949 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STMN1P16949 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STMN1P16949 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STMN1P16949 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STMN1P16949 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STMN1P16949 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STMN1P16949 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STMN1P16949 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STMN1P16949 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STMN1P16949 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STMN1P16949 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STMN1P16949 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STMN1P16949 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms