Protein–RNA interactions for Protein: P16442

ABO, Histo-blood group ABO system transferase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABOP16442 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABOP16442 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABOP16442 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABOP16442 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABOP16442 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABOP16442 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABOP16442 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABOP16442 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABOP16442 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABOP16442 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABOP16442 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABOP16442 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABOP16442 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABOP16442 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABOP16442 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABOP16442 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABOP16442 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABOP16442 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABOP16442 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABOP16442 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABOP16442 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABOP16442 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABOP16442 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABOP16442 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABOP16442 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABOP16442 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABOP16442 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABOP16442 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABOP16442 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABOP16442 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABOP16442 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABOP16442 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABOP16442 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABOP16442 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABOP16442 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABOP16442 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABOP16442 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABOP16442 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABOP16442 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABOP16442 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABOP16442 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABOP16442 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABOP16442 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABOP16442 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABOP16442 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABOP16442 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABOP16442 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABOP16442 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABOP16442 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABOP16442 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABOP16442 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABOP16442 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABOP16442 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABOP16442 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABOP16442 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABOP16442 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABOP16442 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABOP16442 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABOP16442 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABOP16442 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABOP16442 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABOP16442 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABOP16442 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABOP16442 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABOP16442 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABOP16442 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABOP16442 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABOP16442 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABOP16442 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABOP16442 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABOP16442 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABOP16442 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABOP16442 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABOP16442 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABOP16442 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABOP16442 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABOP16442 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABOP16442 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABOP16442 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABOP16442 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABOP16442 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABOP16442 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABOP16442 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABOP16442 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABOP16442 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABOP16442 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABOP16442 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABOP16442 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABOP16442 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABOP16442 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABOP16442 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABOP16442 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABOP16442 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABOP16442 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABOP16442 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms