Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIMP2P16035 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIMP2P16035 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TIMP2P16035 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TIMP2P16035 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIMP2P16035 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIMP2P16035 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIMP2P16035 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TIMP2P16035 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TIMP2P16035 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TIMP2P16035 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms