Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCP1P13796 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCP1P13796 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCP1P13796 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCP1P13796 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCP1P13796 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LCP1P13796 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LCP1P13796 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LCP1P13796 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LCP1P13796 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCP1P13796 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCP1P13796 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LCP1P13796 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LCP1P13796 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LCP1P13796 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCP1P13796 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LCP1P13796 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCP1P13796 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCP1P13796 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCP1P13796 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCP1P13796 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCP1P13796 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCP1P13796 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCP1P13796 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LCP1P13796 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LCP1P13796 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LCP1P13796 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LCP1P13796 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LCP1P13796 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LCP1P13796 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LCP1P13796 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCP1P13796 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCP1P13796 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCP1P13796 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCP1P13796 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCP1P13796 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCP1P13796 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LCP1P13796 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LCP1P13796 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LCP1P13796 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCP1P13796 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCP1P13796 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCP1P13796 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LCP1P13796 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LCP1P13796 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCP1P13796 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCP1P13796 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LCP1P13796 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LCP1P13796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCP1P13796 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCP1P13796 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCP1P13796 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCP1P13796 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LCP1P13796 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LCP1P13796 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LCP1P13796 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LCP1P13796 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LCP1P13796 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCP1P13796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCP1P13796 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCP1P13796 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LCP1P13796 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCP1P13796 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LCP1P13796 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LCP1P13796 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCP1P13796 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCP1P13796 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LCP1P13796 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCP1P13796 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCP1P13796 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LCP1P13796 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCP1P13796 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LCP1P13796 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCP1P13796 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCP1P13796 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LCP1P13796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LCP1P13796 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LCP1P13796 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCP1P13796 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCP1P13796 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LCP1P13796 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCP1P13796 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LCP1P13796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LCP1P13796 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LCP1P13796 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LCP1P13796 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LCP1P13796 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCP1P13796 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCP1P13796 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LCP1P13796 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCP1P13796 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCP1P13796 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LCP1P13796 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms