Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ITGA4P13612 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGA4P13612 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGA4P13612 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ITGA4P13612 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA4P13612 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGA4P13612 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGA4P13612 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGA4P13612 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms