Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 522.16■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 LARP4B-202ENST00000406525 681 ntTSL 530.16■■■□□ 2.423e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 322.68■■□□□ 1.223e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 320.58■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 415.9■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 RHBG-209ENST00000622297 720 ntTSL 515.42■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-208ENST00000481118 421 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 RHBG-203ENST00000494874 324 ntTSL 311.89□□□□□ -0.513e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.461e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.775e-8■■■■■ 42.3
XRCC6P12956 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 42.3
XRCC6P12956 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-42■■■■■ 42.2
XRCC6P12956 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-42■■■■■ 42.2
XRCC6P12956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.24e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.544e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.194e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-205ENST00000505725 566 ntTSL 36.13□□□□□ -1.434e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.648e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 421.27■■□□□ 18e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 417.75■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 527.74■■■□□ 2.032e-14■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 221.69■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 420.94■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 317.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-212ENST00000584641 1101 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-208ENST00000580662 758 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-14■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-209ENST00000580963 520 ntTSL 33.46□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 323.58■■□□□ 1.373e-9■■■■■ 40.7
XRCC6P12956 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-9■■■■■ 40.7
XRCC6P12956 CBL-205ENST00000637974 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.28■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-202ENST00000634301 340 ntTSL 39.55□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.367e-12■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 54□□□□□ -1.777e-12■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.65■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-11■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-209ENST00000604247 2499 nt16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-207ENST00000604010 884 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-214ENST00000605476 2484 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-212ENST00000604925 1013 ntTSL 58.81□□□□□ -12e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 57.61□□□□□ -1.192e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-201ENST00000272249 2190 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-205ENST00000432260 587 ntTSL 34.8□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-214ENST00000541548 535 ntTSL 44.09□□□□□ -1.752e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.772e-9■■■■■ 39
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