Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 522.16■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 42.8
XRCC6P12956 LARP4B-202ENST00000406525 681 ntTSL 530.16■■■□□ 2.423e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 322.68■■□□□ 1.223e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 320.58■□□□□ 0.893e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 415.9■□□□□ 0.143e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 RHBG-209ENST00000622297 720 ntTSL 515.42■□□□□ 0.063e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 LARP4B-208ENST00000481118 421 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 RHBG-203ENST00000494874 324 ntTSL 311.89□□□□□ -0.513e-10■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.311e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.461e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-25■■■■■ 42.4
XRCC6P12956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.775e-8■■■■■ 42.3
XRCC6P12956 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.345e-8■■■■■ 42.3
XRCC6P12956 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-42■■■■■ 42.2
XRCC6P12956 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-42■■■■■ 42.2
XRCC6P12956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.24e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-202ENST00000389010 2741 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.544e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.194e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 BMP2K-205ENST00000505725 566 ntTSL 36.13□□□□□ -1.434e-14■■■■■ 42.1
XRCC6P12956 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.648e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 421.27■■□□□ 18e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-209ENST00000609445 594 ntTSL 417.75■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 41.4
XRCC6P12956 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 527.74■■■□□ 2.032e-14■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 221.69■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 420.94■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 317.88■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-212ENST00000584641 1101 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-208ENST00000580662 758 ntTSL 37.6□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-14■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 HELZ-209ENST00000580963 520 ntTSL 33.46□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 40.8
XRCC6P12956 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 323.58■■□□□ 1.373e-9■■■■■ 40.7
XRCC6P12956 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-9■■■■■ 40.7
XRCC6P12956 CBL-205ENST00000637974 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.28■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 CBL-202ENST00000634301 340 ntTSL 39.55□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 40.4
XRCC6P12956 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 40.2
XRCC6P12956 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 39.9
XRCC6P12956 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.367e-12■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 54□□□□□ -1.777e-12■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-205ENST00000636175 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.65■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-203ENST00000635773 5844 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 39.7
XRCC6P12956 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-11■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-209ENST00000604247 2499 nt16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-207ENST00000604010 884 ntTSL 515.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-214ENST00000605476 2484 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 SRGAP2-212ENST00000604925 1013 ntTSL 58.81□□□□□ -12e-8■■■■■ 39.1
XRCC6P12956 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.322e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.882e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 49.99□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 57.61□□□□□ -1.192e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 HNRNPLL-201ENST00000272249 2190 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-205ENST00000432260 587 ntTSL 34.8□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-214ENST00000541548 535 ntTSL 44.09□□□□□ -1.752e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.772e-9■■■■■ 39
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