Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEPDP12955 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEPDP12955 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEPDP12955 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEPDP12955 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEPDP12955 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEPDP12955 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEPDP12955 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEPDP12955 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEPDP12955 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEPDP12955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEPDP12955 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEPDP12955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEPDP12955 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PEPDP12955 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEPDP12955 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEPDP12955 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PEPDP12955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEPDP12955 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PEPDP12955 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEPDP12955 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEPDP12955 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PEPDP12955 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEPDP12955 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEPDP12955 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEPDP12955 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEPDP12955 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEPDP12955 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEPDP12955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEPDP12955 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEPDP12955 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEPDP12955 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEPDP12955 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEPDP12955 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEPDP12955 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEPDP12955 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEPDP12955 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEPDP12955 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEPDP12955 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEPDP12955 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEPDP12955 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEPDP12955 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEPDP12955 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEPDP12955 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEPDP12955 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEPDP12955 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEPDP12955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEPDP12955 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEPDP12955 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEPDP12955 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEPDP12955 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEPDP12955 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PEPDP12955 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEPDP12955 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEPDP12955 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PEPDP12955 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PEPDP12955 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PEPDP12955 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEPDP12955 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEPDP12955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEPDP12955 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEPDP12955 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEPDP12955 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEPDP12955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEPDP12955 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEPDP12955 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEPDP12955 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEPDP12955 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEPDP12955 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEPDP12955 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEPDP12955 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEPDP12955 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEPDP12955 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEPDP12955 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEPDP12955 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEPDP12955 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEPDP12955 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEPDP12955 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PEPDP12955 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEPDP12955 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEPDP12955 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEPDP12955 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEPDP12955 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEPDP12955 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEPDP12955 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEPDP12955 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEPDP12955 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEPDP12955 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEPDP12955 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEPDP12955 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEPDP12955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PEPDP12955 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PEPDP12955 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEPDP12955 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PEPDP12955 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms