Protein–RNA interactions for Protein: P11498

PC, Pyruvate carboxylase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP11498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCP11498 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PCP11498 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCP11498 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCP11498 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PCP11498 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCP11498 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCP11498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCP11498 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCP11498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCP11498 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCP11498 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCP11498 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCP11498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCP11498 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCP11498 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCP11498 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCP11498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCP11498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PCP11498 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PCP11498 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCP11498 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCP11498 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCP11498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCP11498 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCP11498 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCP11498 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PCP11498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PCP11498 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PCP11498 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PCP11498 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PCP11498 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PCP11498 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PCP11498 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PCP11498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PCP11498 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PCP11498 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PCP11498 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PCP11498 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PCP11498 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PCP11498 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PCP11498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PCP11498 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PCP11498 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PCP11498 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCP11498 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PCP11498 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PCP11498 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PCP11498 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PCP11498 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PCP11498 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PCP11498 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PCP11498 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PCP11498 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PCP11498 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCP11498 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCP11498 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PCP11498 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PCP11498 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCP11498 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCP11498 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PCP11498 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCP11498 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PCP11498 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PCP11498 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCP11498 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PCP11498 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PCP11498 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCP11498 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PCP11498 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PCP11498 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PCP11498 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCP11498 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PCP11498 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PCP11498 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCP11498 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PCP11498 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCP11498 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCP11498 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PCP11498 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCP11498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCP11498 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PCP11498 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PCP11498 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCP11498 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCP11498 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCP11498 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PCP11498 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCP11498 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PCP11498 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCP11498 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PCP11498 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCP11498 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCP11498 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PCP11498 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms