Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP1P11387 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP1P11387 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP1P11387 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP1P11387 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TOP1P11387 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP1P11387 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TOP1P11387 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP1P11387 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TOP1P11387 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TOP1P11387 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP1P11387 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TOP1P11387 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP1P11387 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP1P11387 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TOP1P11387 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
TOP1P11387 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TOP1P11387 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP1P11387 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TOP1P11387 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TOP1P11387 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP1P11387 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP1P11387 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TOP1P11387 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP1P11387 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP1P11387 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TOP1P11387 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP1P11387 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TOP1P11387 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TOP1P11387 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP1P11387 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TOP1P11387 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOP1P11387 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP1P11387 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP1P11387 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP1P11387 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP1P11387 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOP1P11387 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP1P11387 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOP1P11387 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP1P11387 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP1P11387 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP1P11387 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOP1P11387 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1P11387 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1P11387 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1P11387 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOP1P11387 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP1P11387 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP1P11387 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP1P11387 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP1P11387 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP1P11387 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP1P11387 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP1P11387 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP1P11387 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP1P11387 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP1P11387 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP1P11387 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP1P11387 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP1P11387 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TOP1P11387 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP1P11387 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP1P11387 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP1P11387 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TOP1P11387 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TOP1P11387 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TOP1P11387 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP1P11387 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP1P11387 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TOP1P11387 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TOP1P11387 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP1P11387 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TOP1P11387 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP1P11387 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP1P11387 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TOP1P11387 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP1P11387 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP1P11387 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP1P11387 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TOP1P11387 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TOP1P11387 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TOP1P11387 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1P11387 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1P11387 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TOP1P11387 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP1P11387 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP1P11387 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP1P11387 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP1P11387 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TOP1P11387 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP1P11387 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP1P11387 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TOP1P11387 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TOP1P11387 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms