Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP10827 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP10827 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THRAP10827 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THRAP10827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP10827 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP10827 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP10827 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THRAP10827 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP10827 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP10827 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
THRAP10827 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
THRAP10827 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THRAP10827 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THRAP10827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
THRAP10827 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THRAP10827 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
THRAP10827 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
THRAP10827 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
THRAP10827 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THRAP10827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
THRAP10827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
THRAP10827 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
THRAP10827 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
THRAP10827 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP10827 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
THRAP10827 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP10827 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP10827 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
THRAP10827 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP10827 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP10827 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
THRAP10827 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP10827 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THRAP10827 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP10827 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP10827 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP10827 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP10827 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THRAP10827 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THRAP10827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THRAP10827 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP10827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THRAP10827 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
THRAP10827 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP10827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THRAP10827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THRAP10827 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP10827 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP10827 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP10827 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP10827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THRAP10827 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THRAP10827 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THRAP10827 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
THRAP10827 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP10827 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
THRAP10827 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP10827 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP10827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
THRAP10827 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP10827 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP10827 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
THRAP10827 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP10827 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP10827 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP10827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
THRAP10827 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
THRAP10827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THRAP10827 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
THRAP10827 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
THRAP10827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
THRAP10827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
THRAP10827 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
THRAP10827 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
THRAP10827 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
THRAP10827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
THRAP10827 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THRAP10827 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THRAP10827 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
THRAP10827 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THRAP10827 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
THRAP10827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
THRAP10827 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
THRAP10827 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THRAP10827 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THRAP10827 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
THRAP10827 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THRAP10827 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THRAP10827 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THRAP10827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
THRAP10827 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
THRAP10827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP10827 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP10827 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THRAP10827 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP10827 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP10827 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP10827 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THRAP10827 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms