Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HOXB7P09629 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HOXB7P09629 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HOXB7P09629 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HOXB7P09629 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HOXB7P09629 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HOXB7P09629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HOXB7P09629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HOXB7P09629 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HOXB7P09629 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HOXB7P09629 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HOXB7P09629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms